La verdadera obsesión de la carrera de Carl Zeiss fue desarrollar una base teórica para la fabricación de los microscopios. Una inquietud que años más tarde se vio solventada en parte, gracias a la colaboración del físico Ernst Abbe, que por aquel entonces era profesor en la Universidad de Jena, Alemania. Juntos sentaron las bases de la óptica moderna y comenzaron a construir microscopios con la máxima resolución físicamente alcanzable (gracias a los hallazgos de Abbe). Y así fue como en el año 76, Ernst Abbe se convirtió en el socio de Zeiss y la empresa comenzó a crecer exponencialmente.